清洗消毒：加强清洗消毒是防止仔猪下痢最主要的措施，但问题是应该怎样清洗产栏才能有效地防止仔猪下痢。因为产栏地面上存在着母猪乳汁及仔猪下痢所形成的脂肪层以及残存的粪便和饲料等，其中含有大量的病原微生物，是发生仔猪下痢等疫病最主要的传染源，因此，只有彻底清除脂肪层及残存的粪便、饲料等，才能有效的控制仔猪下痢。
清洗产栏时首先应用洗涤剂或烧碱溶液浸泡地面，以破坏地面上的脂肪层，多用高压水彻底冲洗地面，以彻底清除地面的脂肪层及残留饲料和粪便等。清洗之后，让产栏自然干燥，然后再用消毒剂喷洒圈栏和地面，干燥后即可再次冲洗产栏，这样可有效地避免消毒剂对仔猪的伤害。经清洗消毒后的产栏再空栏干燥2天-3天后，就可将临产母猪转入产栏待产。临产母猪转入产栏前，也应进行彻底的清洗，特别是乳房和阴部。
全进全出：实行全进全出的产仔制度，有助于控制新生仔猪下痢。因为只有采用全进全出，才有可能对产栏进行彻底的清洁和消毒，阻止仔猪下痢等病的传播。
环境控制：仔猪生活在舒适的环境中，可以增强仔猪对传染病的非特异性抵抗力。对仔猪来说，舒适的环境并不仅仅是清洁干燥，还应该温暖而无贼风，环境条件的改变会使仔猪遭受应激而易于发生下痢等疫病。饥饿和脱水也会促使仔猪发病，因此，吃饱奶和饮用充足的清洁饮水对控制仔猪下痢等疫病也十分重要。
免疫措施：刺激母猪产生免疫力，使得母猪可将其免疫力传递给新生仔猪，从而提高仔猪对下痢等疫病的免疫力。对妊娠后期的母猪免疫接种大肠杆菌疫苗，以及在妊娠后期用下痢仔猪的粪便饲喂妊娠母猪，均可有效地刺激母猪产生免疫力，这种免疫力可以通过乳汁传递给仔猪，从而提高仔猪对下痢等病的抵抗力。
及时治疗：如果预防措施无效而使仔猪发生了下痢，那么就应立即对仔猪进行治疗。因为细菌的繁殖速度极快，其数量每天都会成倍增长，如果等到第2天才开始治疗，这样就延误治疗，使病原细菌的数量有机会增加。
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